如果女性患有的巧克力囊腫比較小，平時不伴有明顯的不適，這個時候可以懷孕，巧克力囊腫對懷孕的影響比較小。如果巧克力囊腫比較大，導致身體不適癥狀嚴重，這個時候女性不可以懷孕。

巧克力囊腫懷孕難度就會比較高，或者說懷孕的可能性就比較低，一般來說就是子宮內(nèi)膜跑到卵巢里面可以影響到正常的女性，卵巢排卵功能，所以說這是影響懷孕的主要因素，巧克力囊腫很少出現(xiàn)左右兩邊同時存在，所以說只要能夠正常排卵，那么還是有懷孕的可能性的。