腦干腫瘤的病因不明確，一般情況下和遺傳、環(huán)境、年齡等因素有關。

1、遺傳

研究發(fā)現(xiàn)腦干腫瘤的發(fā)生于特定的基因多態(tài)性相關，有可能存在家族遺傳傾向。

2、環(huán)境

可能部分致癌環(huán)境因素與腦干腫瘤的發(fā)生密切相關，如長時間使用手機或者接觸高壓電等。

3、年齡

腦干腫瘤的發(fā)生還有可能與年齡相關，不同類型的腫瘤，發(fā)病年齡高峰不同，如腦干膠質瘤，第一個高峰在5-10歲，第二個高峰在40-50歲，多見于青少年。另外，室管膜瘤多見于中年人。