真菌性角膜炎的治療方法有一般治療、藥物治療、手術治療等。

1、一般治療

有明顯誘因的患者要盡量避免誘因，若是佩戴隱形眼鏡引起的真菌性角膜炎，應該避免繼續(xù)佩戴。同時要注意眼部衛(wèi)生，注意安全，避免眼部再次受傷。

2、藥物治療

患者可遵醫(yī)囑局部使用抗菌藥物，如0.25%兩性霉素B眼藥水、5%那他霉素、0.5%咪康唑、1%氟胞嘧啶等。嚴重真菌感染者需要聯(lián)合全身使用抗真菌藥物治療，如伊曲康唑、酮康唑、氟康唑等藥。

3、手術治療

藥物治療效果不理想的患者可以考慮手術治療，常用的手術方式有清創(chuàng)術、結膜瓣遮蓋術和角膜移植術。