目前,對大多數(shù)遺傳性代謝病仍無特殊治療方法,但許多疾病通過相應(yīng)的對癥或支持治療可得到有效控制。其治療原則為減少累積、補(bǔ)充所需、促進(jìn)排泄。氨基酸、有機(jī)酸、脂肪酸、糖代謝異常多以飲食治療為主,部分疾患可通過維生素、輔酶等進(jìn)行治療。極少數(shù)代謝病可通過酶的替代治療、造血干細(xì)胞移植、器官移植矯正,基因治療仍在研究中。遺傳性代謝病較多見的臨床問題是智力障礙、運動障礙、語言障礙和心理行為發(fā)育異常,這些問題的處理有時無特殊飲食或藥物(如肌眼腦病),而且許多患者明確診斷并經(jīng)飲食和藥物等治療后,神經(jīng)系統(tǒng)后遺癥表現(xiàn)突出,此類患者的神經(jīng)康復(fù)也是一個漫長的過程(如多種羧化化酶缺陷病所致的腦損傷后遺癥)