雖然任何由軟骨化骨的骨骼均可生長骨軟骨瘤，但長管狀骨比扁骨、短骨更多見。其中股骨遠(yuǎn)端、脛骨近端和肱骨近端最為多見。
由于該腫瘤不產(chǎn)生疼痛，多因偶然摸到腫塊，或X線檢查發(fā)現(xiàn)腫瘤。局部多無壓痛。有些因壓迫血管、神經(jīng)及內(nèi)臟器官，產(chǎn)生相應(yīng)的癥狀。常是意外中摸到腫物或在X線照片上偶然發(fā)現(xiàn)異常。多數(shù)沒有癥狀。
股骨下端或脛骨上端的內(nèi)側(cè)骨疣可有肌腱滑動感。腫物遭到直接沖擊或蒂部發(fā)生骨折以后才會有疼痛感覺。瘤體較大時(shí)可壓迫神經(jīng)。腰椎的骨疣可發(fā)生馬尾神經(jīng)的壓迫癥狀。足和踝部腫物會使走路和穿鞋困難。有的可并發(fā)滑囊或滑囊炎。