主要原因：食物不耐受
由于家長對嬰兒食物過敏腸病缺乏認識，不少孩子被長期診斷為慢性腸炎或痢疾，長期服用甚至靜脈輸抗生素，某些父母因孩子腹瀉久治不愈而身心憔悴。嚴(yán)重的嬰兒食物過敏可引起體格生長發(fā)育落后、免疫力下降而易發(fā)感染。
食物過敏腸病發(fā)生率增加，原因存分歧
有些專家指出：是人類食品的多樣化尤其是人工食品增加、過敏體質(zhì)的嬰兒增加(而嬰兒的過敏體質(zhì)與母親孕期對胎兒的致敏有關(guān))導(dǎo)致的，也可能與預(yù)防接種增多有關(guān)。
從宏觀上看，當(dāng)前嬰兒對食物過敏、不耐受增多也是人類生活方式變化、人與自然協(xié)調(diào)和人類演化過程的表現(xiàn)。