(一)、遺傳因素 尿道下裂發(fā)病有較明顯的家族傾向。有報(bào)道尿道下裂患者中染色體畸變率明顯高于正常人群。還有人認(rèn)為性別分化相關(guān)基因突變?nèi)缧奂に厥荏w基因(AR)和性別決定基因(SRY)突變和尿道下裂的關(guān)系密切。
(二)、環(huán)境因素 有研究發(fā)現(xiàn)在妊娠早期用過孕酮保胎藥物或其它藥物等及冬天受孕的胎兒中尿道下裂的發(fā)生率較高。
(三)、激素因素 胎睪中產(chǎn)生的激素影響男性外生殖器的形成，其形成約在胚胎第14周完成。而這個(gè)發(fā)育過程是需要雙氫睪酮的刺激來完成的。雙氫睪酮是由胎兒睪丸分泌的睪酮在5α-還原酶的作用下轉(zhuǎn)化而來。因此，在胎兒陰莖形成過程中，凡是睪酮產(chǎn)生不足，過遲或睪酮轉(zhuǎn)化為雙氫睪酮的過程中出現(xiàn)異常均可導(dǎo)致生殖器畸形。