急性感染性腹瀉患者于常規(guī)做細(xì)菌培養(yǎng)的同時，如懷疑有病毒感染可能者應(yīng)做糞便病毒分離和特異性的血清病毒抗體檢測，必要時用電鏡判明病毒病原的性質(zhì)。
急性腹瀉恢復(fù)期
對早期有膿血便和病原陽性的患者，可做乙狀結(jié)腸鏡檢;對治療不順利或有慢性化趨向者，鏡檢有陽性發(fā)現(xiàn)者可進(jìn)行活體組織檢查。
慢性腹瀉患者一般宜先行直腸或乙狀結(jié)腸鏡檢查，必要時做纖維結(jié)腸鏡或纖維小腸鏡檢查，對所見腸道粘膜的炎癥性或贅生性病變等具有肯定的診斷價值。懷疑膽道和胰腺病變時，做內(nèi)鏡逆行胰膽管造影(ERCP)有重要價值。
X線鋇餐、鋇灌腸檢查和腹部平片，可顯示胃腸道病變，運動功能狀態(tài)，膽石、胰腺或淋巴結(jié)鈣化或部分腸梗阻等病變。對消化道有無器質(zhì)性病變和病變部位，常有明確診斷價值。
B超、CT或MRI(核磁共振)?？闪私飧?、膽、胰等內(nèi)臟病變，對癌和消化系腫瘤引起的腹瀉尤有價值。