崇禎十四年(1641年) 冬，李自成軍入豫，李際遇與之合軍，攻克登封縣城。

　　清

　　順治十三年(1656年) 海寬入京師，刊《五家宗派世譜定祖圖》。次年領(lǐng)禮部札子，為清代第一位住持。

　　康熙四十三年(1704年) 圣祖御書(shū)“寶樹(shù)芳蓮”及“少林寺”匾額，賜少林寺。

　　雍正十三年(1735年) 世宗御批重修少林寺，整頓少林寺門(mén)頭。乾隆初年，由河?xùn)|總督、河南巡撫王士俊主持重修少林寺，費(fèi)銀九千兩。

　　乾隆五年(1740年) 河南巡撫雅爾圖上奏“少林寺僧徒，向以教習(xí)拳棒為名。”

　　乾隆十二年(1747年) 施奕簪、焦如衡編定《少林寺志》四卷，五萬(wàn)余字，次年刊梓。

　　乾隆十五年(1750年) 九月三十日，高宗巡幸少林寺，題詩(shī)書(shū)匾，夜宿少林寺方丈室。

　　道光八年(1828年) 河南道員麟慶代巡撫楊海梁祭祀嵩山時(shí)，至少林寺觀看武僧校拳。

　　道光三十年(1850年) 鴉片戰(zhàn)爭(zhēng)結(jié)束，政府軍隊(duì)普遍配備火器，武術(shù)普遍民間化。上層社會(huì)武術(shù)功能轉(zhuǎn)向健身。

　　咸豐四年(1854年) 王祖源入少林寺習(xí)《易筋經(jīng)》，晚年刊《內(nèi)功圖說(shuō)》行世。

　　同治元年(1862年) 捻軍西征，三月至九月兩次過(guò)登封縣境。是年蝗災(zāi)。

　　中華民國(guó)

　　民國(guó)初年(1911-1920年) 世局動(dòng)亂，土匪蜂起，少林寺購(gòu)置火器成立保衛(wèi)團(tuán)，當(dāng)家和尚恒林任團(tuán)長(zhǎng)。

　　民國(guó)四年(1915年) 民國(guó)政府教育部通令武術(shù)進(jìn)入西方模式新式學(xué)校課程。

　　民國(guó)五年(1916年)王云華修葺緊那羅神殿。

　　民國(guó)十二年(1923年) 恒林圓寂，弟子妙興繼任。吳佩孚部收編少林寺保衛(wèi)團(tuán)為第一團(tuán)，妙興任團(tuán)長(zhǎng)。

　　民國(guó)十六年(1927年) 妙興率團(tuán)赴舞陽(yáng)，與任應(yīng)岐部交戰(zhàn)陣亡，保衛(wèi)團(tuán)武僧四散。

　　民國(guó)十七年(1928年) 三月十五日，國(guó)民軍石友三火燒少林寺。天王殿、大雄殿、客堂、鐘鼓樓、藏經(jīng)樓及所藏之大藏經(jīng)、《少林寺志》木版、北朝石刻造像碑等皆毀。

　　民國(guó)十七年(1928年) 民國(guó)政府成立中央國(guó)術(shù)館，省、市、縣通設(shè)國(guó)術(shù)館(社)。大批民間拳師進(jìn)城任教。以“增進(jìn)全民健康為宗旨”。“仿舊時(shí)武科考試和近代體育競(jìng)賽，”舉行全國(guó)國(guó)術(shù)考試。武術(shù)走向競(jìng)賽標(biāo)準(zhǔn)化。

　　民國(guó)二十年(1930年)唐豪出版《少林武術(shù)考》。

　　民國(guó)二十五年(1936年)日本武士宗道臣至少林寺學(xué)藝。回日本后，創(chuàng)立日本少林寺拳法聯(lián)盟。